RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.14■□□□□ 0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.12■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPAL2Q9H841 368 aa15.12■□□□□ 0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STMND1H3BQB6 276 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABRA2P47869 451 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASAH1Q13510 395 aa15.11■□□□□ 0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF681Q96N22 645 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.11■□□□□ 0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETV7Q9Y603 341 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.11■□□□□ 0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFSO43281 561 aa15.11■□□□□ 0.01
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