RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 AQP4P55087 323 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TAF11Q15544 211 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OR7A5Q15622 319 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 HFEQ30201 348 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM225Q6GV28 225 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM86BQ8N661 226 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NATD1Q8N6N6 113 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF570Q96NI8 536 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 MARCH7Q9H992 704 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 MKLN1Q9UL63 735 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 HERC2O95714 4834 aa6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 RYR1P21817 5038 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 AGAP5A6NIR3 686 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CLDN24A6NM45 220 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 AP3D1O14617 1153 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 DHHO43323 396 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SLC43A1O75387 559 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 VAMP5O95183 116 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 KRT75O95678 551 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV2-70P01814 119 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 MELTFP08582 738 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 BMP2P12643 396 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 FASP25445 335 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TACR3P29371 465 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 AQP1P29972 269 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 KDELR2P33947 212 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CRATP43155 626 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CAPZA2P47755 286 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CRYBA2P53672 197 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 FADDQ13158 208 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TP53BP2Q13625 1128 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6AP1Q15904 470 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 GSG1Q2KHT4 349 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF627Q7L945 461 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ANKFN1Q8N957 763 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CCL17Q92583 94 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ZG16BQ96DA0 208 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NEURL3Q96EH8 262 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SLC29A1Q99808 456 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CHID1Q9BWS9 393 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 VCX3BQ9H321 246 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 NOX4Q9NPH5 578 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 RCE1Q9Y256 329 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.05□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 ISPDA4D126 451 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 FAAHO00519 579 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 SOCS2O14508 198 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PIP5K1CO60331 668 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 STX11O75558 287 aa6.04□□□□□ -1.44
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R3DO95685 299 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms