RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MAB21L1	Q13394	359 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF77	Q15935	545 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZBED5	Q49AG3	693 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SCD5	Q86SK9	330 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MED8	Q96G25	268 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	OR8B4	Q96RC9	309 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SORT1	Q99523	831 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ATP5S	Q99766	215 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MFF	Q9GZY8	342 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	PXMP2	Q9NR77	195 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	PIK3R4	Q99570	1358 aa		2.57	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS37	A4D1T9	235 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R2P9	O14990	202 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SOX15	O60248	233 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MGRN1	O60291	552 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	HUS1	O60921	280 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	STAG3L2	P0CL84	134 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF30	P17039	623 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF136	P52737	540 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	RAB10	P61026	200 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	RAB11A	P62491	216 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LIPE	Q05469	1076 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	AQP6	Q13520	282 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	RAB11B	Q15907	218 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	C22orf42	Q6IC83	251 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TTC23L	Q6PF05	361 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LIX1	Q8N485	282 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334		Q8N976	141 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SPERT	Q8NA61	448 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	GPX8	Q8TED1	209 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	KIFAP3	Q92845	792 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC58	Q96CX6	371 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	HSFY1	Q96LI6	401 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	EXD2	Q9NVH0	621 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IFNK	Q9P0W0	207 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	NFASC	O94856	1347 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	INSR	P06213	1382 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MSH6	P52701	1360 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	KIF27	Q86VH2	1401 aa		2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334		M0QX08	132 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFS8	O00217	210 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	XKRY	O14609	159 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	RAB29	O14966	203 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	SPAG7	O75391	227 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	MED6	O75586	246 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CCNB2	O95067	398 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	CSTA	P01040	98 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	IGHV2-5	P01817	119 aa		2.55	□□□□□ -2
RBM39-231	ENST00000477334	FGF1	P05230	155 aa		2.55	□□□□□ -2

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