RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 AVPI1Q5T686 147 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SPACA7Q96KW9 195 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CST11Q9H112 138 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.22□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC31A1O15431 190 aa12.21□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 CMKLR1Q99788 373 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 HRH4Q9H3N8 390 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM100Q9NV29 134 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf51A6NDU8 294 aa12.21□□□□□ -0.46
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC17A2O00624 439 aa12.21□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 AGPAT2O15120 278 aa12.21□□□□□ -0.46
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