RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OCEL1Q9H607 264 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R5Q9NYW4 299 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 B4DSR2 109 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 G3V2T6 193 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CCNB2O95067 398 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 BCL10O95999 233 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 GPR4P46093 362 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CLRN1P58418 232 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ACTG1P63261 375 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 IGFN1Q86VF2 1251 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 WDFY1Q8IWB7 410 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CDK20Q8IZL9 346 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 C3orf56Q8N813 242 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 NUP37Q8NFH4 326 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 IL17RDQ8NFM7 739 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MOSPD2Q8NHP6 518 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF566Q969W8 418 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 JMJD8Q96S16 334 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 INIPQ9NRY2 104 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TRAV27A0A087WT01 109 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRQ8 180 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LRP5LA4QPB2 252 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB9A8MZ26 197 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SOCS2O14508 198 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 EI24O14681 340 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 B4GALT1P15291 398 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NPR2P20594 1047 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MAKP20794 623 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 PRKACGP22612 351 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 LIMS1P48059 325 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CDH15P55291 814 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NAAAQ02083 359 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZP4Q12836 540 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NPRL3Q12980 569 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DGCR6Q14129 220 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SEC23BQ15437 767 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ADIPOQQ15848 244 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ALG10Q5BKT4 473 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 VHLLQ6RSH7 139 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF786Q8N393 782 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GALNT4Q8N4A0 578 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CBR4Q8N4T8 237 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR9Q2Q8NGE9 314 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR51A7Q8NH64 312 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GIPC3Q8TF64 312 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 NRBF2Q96F24 287 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 C1orf159Q96HA4 380 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 VCX3BQ9H321 246 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WUU8 490 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OR10H3O60404 316 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 IGHG1P01857 330 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 CD79AP11912 226 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 VHLP40337 213 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 HMGA2P52926 109 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MYBPC1Q00872 1141 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 DAG1Q14118 895 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 GK3PQ14409 553 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 MICAQ29983 383 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 OAFQ86UD1 273 aa10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PRAME-210ENST00000442481 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms