RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A12Q96S37 553 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST8Q9H2A9 424 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SSR4P51571 173 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CSNK1G2P78368 415 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RBPJQ06330 500 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL16Q0P5N6 197 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RASD2Q96D21 266 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OSGIN2Q9Y236 505 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MMACHCQ9Y4U1 282 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5K3A6NET4 321 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS11O94810 467 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 KLKB1P03952 638 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 EDDM3BP56851 147 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PMPCAQ10713 525 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RUNX2Q13950 521 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT13Q7L8C5 426 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 REEP6Q96HR9 211 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX37Q96LM6 180 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR78Q96P69 363 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SIP14410 1827 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 G3V3Y1 287 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO2B1O94956 709 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC2A1P11166 492 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GSK3AP49840 483 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DCDP81605 110 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMUB2Q71RG4 321 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DCXRQ7Z4W1 244 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 VRK3Q8IV63 474 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHDC9Q8NEP7 349 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ARRDC3Q96B67 414 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TPPP3Q9BW30 176 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB1Q9H4B7 451 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 BCO1Q9HAY6 547 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SPINT2O43291 252 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-ATP6P00846 226 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13C7P0DN81 318 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PTAFRP25105 342 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX2P48378 723 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OXA1LQ15070 435 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 TOR2AQ5JU69 321 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NAXDQ8IW45 347 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC16AO15027 2179 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF724A8MTY0 619 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ALX3O95076 343 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHEP01854 428 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 RAF1P04049 648 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 THBS1P07996 1170 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 NID1P14543 1247 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP6Q16828 381 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 ISL2Q96A47 359 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PDXPQ96GD0 296 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 PBX4Q9BYU1 374 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-202ENST00000426333 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms