RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 BLACEA4D250 179 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 XKRYO14609 159 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT14O95848 222 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAIN1P0CW23 69 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS3P35030 304 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF117Q03924 483 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB11BQ15907 218 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf46Q504U0 113 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EXO5Q9H790 373 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPP00491 289 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCR1P25024 350 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TCTN2Q96GX1 697 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT16Q9UBV4 365 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TECTAO75443 2155 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CD1CP29017 333 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAND1P57086 179 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MNTQ99583 582 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A3Q99624 504 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SPARCP09486 303 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CSF2RBP32927 897 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PPICP45877 212 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 BLKP51451 505 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SERTAD2Q14140 314 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MELKQ14680 651 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A1Q14916 467 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8B4Q96RC9 309 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TPPPO94811 219 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 LPLP06858 475 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 FNTBP49356 437 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 BIKQ13323 160 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TSLPQ969D9 159 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM19Q9H013 955 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 HMSDA8MTL9 139 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PHYHO14832 338 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DOK2O60496 412 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6A2O95222 327 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRA1P14867 456 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL12P48061 93 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ETFDHQ16134 617 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 STEAP1BQ6NZ63 245 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MDGA2Q7Z553 956 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCH3Q86UD3 253 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRDQ9H2X0 955 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 APMAPQ9HDC9 416 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 B9D1Q9UPM9 204 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 K7ESF4 209 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A2O00624 439 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN4O14817 238 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A7O60669 478 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 B3GALNT1O75752 331 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 BGLAPP02818 100 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP3CBP16298 524 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ZP3P21754 424 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT77Q7Z794 578 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SCARB1Q8WTV0 552 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PCNX3Q9H6A9 2034 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS8O00214 317 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT11O96014 354 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1D4P47884 311 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SORDQ00796 357 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOCQ15369 112 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ACKR1Q16570 336 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF627Q7L945 461 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SHDQ96IW2 340 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 LAT2Q9GZY6 243 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PPA2Q9H2U2 334 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MED11Q9P086 117 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DHDHQ9UQ10 334 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.8■□□□□ 0.28
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