RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 CLN3Q13286 438 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF534Q76KX8 674 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 C20orf202A1L168 122 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 GLAP06280 429 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SHC1P29353 583 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 USP51Q70EK9 711 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SHPRHQ149N8 1683 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 CORO6Q6QEF8 472 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM200AQ86VY9 491 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 GOSR1O95249 250 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 RNF150Q9ULK6 438 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SOX18P35713 384 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF77Q15935 545 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TMEM230Q96A57 120 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHST11Q9NPF2 352 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 USP22Q9UPT9 525 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 MYOM1P52179 1685 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 VASH2Q86V25 355 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 CXCL13O43927 109 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 I6L893 689 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 NAGAP17050 411 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC19A1P41440 591 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 MAGEB1P43366 347 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 UBA52P62987 128 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 OPCMLQ14982 345 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 RDH5Q92781 318 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 Q96M85 177 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZFP92A6NM28 416 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 MT-ATP6P00846 226 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 HNF1AP20823 631 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCL7P80098 99 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 PYCR3Q53H96 274 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUDT19A8MXV4 375 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 TNFRSF10CO14798 259 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 M6PRP20645 277 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 OIP5O43482 229 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 CDC20BQ86Y33 519 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 TSLPQ969D9 159 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 PLAC9Q5JTB6 97 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 METRNLQ641Q3 311 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 LSMEM2Q8N112 164 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR2T11Q8NH01 316 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 R4GN57 208 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ABLIM3O94929 683 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 CMTM3Q96MX0 182 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 S1PR3Q99500 378 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 SPRY3O43610 288 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 OR11G2Q8NGC1 345 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCORP1Q8N888 145 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 FAM122AQ96E09 287 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 LYRM4Q9HD34 91 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 HBE1P02100 147 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 RBP2P50120 134 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 BCL7AQ4VC05 210 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ST8SIA4Q92187 359 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 XRCC3O43542 346 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 PCSK6P29122 969 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 GDNFP39905 211 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ADIRFQ15847 76 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms