RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 I3L521 148 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMTOR5O43504 91 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 XRCC3O43542 346 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF250P15622 560 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ITPKBP27987 946 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 MARCH3Q86UD3 253 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 GSX2Q9BZM3 304 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB33BQ9H082 229 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN2O60636 221 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RRASP10301 218 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CFPP27918 469 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN6P56747 220 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF7P61962 342 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GX78 115 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQD3 144 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PLSCR5A0PG75 271 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R233 179 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 IL5P05113 134 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 IL12BP29460 328 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN5P62079 268 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ODF4Q2M2E3 257 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR38Q5JTN6 314 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PMEPA1Q969W9 287 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 B9D1Q9UPM9 204 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG1L2C9J202 215 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf98E9PRG8 122 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFB6O95139 128 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 AANATQ16613 207 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8K3Q8NH51 312 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 EDAQ92838 391 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2A4O95047 310 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT14O95848 222 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB14P61106 215 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MVB12AQ96EY5 273 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2A7Q96R45 310 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8B4Q96RC9 309 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BSH0 61 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 XKRYO14609 159 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TO15178 435 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDOBP05062 364 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC17A1Q14916 467 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OPCMLQ14982 345 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF626Q68DY1 528 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF519Q8TB69 540 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CHIAQ9BZP6 476 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CA10Q9NS85 328 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS37A4D1T9 235 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 H7C417 338 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MASP2O00187 686 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-ATP6P00846 226 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SGCBQ16585 318 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MEP1BQ16820 701 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 COX15Q7KZN9 410 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2M5A3KFT3 312 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SNAPC5O75971 98 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 PGCP20142 388 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 ACKR1Q16570 336 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-201ENST00000357436 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms