RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 H7C1Q1 480 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 PRRG2O14669 202 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 TNFSF11O14788 317 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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PTPRM-201ENST00000332175 PROCRQ9UNN8 238 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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PTPRM-201ENST00000332175 OR2J2O76002 312 aa20.45■□□□□ 0.86
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