RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 PLA1AQ53H76 456 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 NSMAFQ92636 917 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MED18Q9BUE0 208 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LRP4O75096 1905 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 PLPP2O43688 288 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 AKR7A3O95154 331 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SNAPINO95295 136 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 OR2T7P0C7T2 308 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 GP1BBP13224 206 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 HLA-DOBP13765 273 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CAPZA1P52907 286 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 NRG3P56975 720 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ACTC1P68032 377 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ACTA1P68133 377 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FCRLAQ7L513 359 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 OR2T27Q8NH04 317 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MNTQ99583 582 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 EMC6Q9BV81 110 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CA10Q9NS85 328 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 GPR160Q9UJ42 338 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FRYQ5TBA9 3013 aa9.13□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TO15178 435 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 IL33O95760 270 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 HEXBP07686 556 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 NPR2P20594 1047 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 RAD52P43351 418 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MTNR1BP49286 362 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FOXK1P85037 733 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MESTQ5EB52 335 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 EID2Q8N6I1 236 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LRRC46Q96FV0 321 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LDAHQ9H6V9 325 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1B0GX78 115 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SUSD5O60279 629 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF806P0C7X5 589 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 PRPS1P60891 318 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00346Q8IVM7 164 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SMIM19Q96E16 107 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ARL5BQ96KC2 179 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 C5orf34Q96MH7 638 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 H7C2Y5 167 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SLC19A2O60779 497 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 GLB1P16278 677 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CXCL2P19875 107 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZP3P21754 424 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CASP6P55212 293 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZP1P60852 638 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FMODQ06828 376 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 OR7A5Q15622 319 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 HFEQ30201 348 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 MED29Q9NX70 200 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.12□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 CACNA1GO43497 2377 aa9.11□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1B0GV90 55 aa9.11□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 IGF2P01344 180 aa9.11□□□□□ -0.95
FOXN4-201ENST00000299162 FOSL2P15408 326 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms