RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPK2O43353 540 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF13O43567 381 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2ABP04908 130 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BCHEP06276 602 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNGP07510 517 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT2P09544 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GCAP28676 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBR2P37173 567 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CRATP43155 626 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NPY4RP50391 375 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DSTNP60981 165 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PCBD1P61457 104 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1CBP62140 327 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PCLAFQ15004 111 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HERPUD1Q15011 391 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ8Q15842 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL22Q53GT1 634 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 COX20Q5RI15 118 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 XP32Q5T750 250 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT73Q86Y46 540 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KLBQ86Z14 1044 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5J2Q8NH18 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD4Q8TB40 342 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM54Q969K7 222 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC15Q96J42 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGDIGQ99819 225 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3GL3Q99963 347 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPHQ9H3R5 247 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPM1 405 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MCIDASD6RGH6 385 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf98E9PRG8 122 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM178BH3BS89 294 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPP3O14495 311 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RFXANKO14593 260 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PHYHO14832 338 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FSTL3O95633 263 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 QDPRP09417 244 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PRG2P13727 222 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DOBP13765 273 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA3P29320 983 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PITPNBP48739 271 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF12P61328 243 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK5R2Q13319 367 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZMYND11Q15326 602 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC18Q8N456 261 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS10Q8TAM1 723 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MZB1Q8WU39 189 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf30Q96M34 536 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52E6Q96RD3 313 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RMND5AQ9H871 391 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SIAEQ9HAT2 523 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM165Q9HC07 324 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MSL2Q9HCI7 577 aa6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GWA3 101 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRG6 482 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR37O15354 613 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN9O75954 239 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TOX4O94842 621 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 HPRP00739 348 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FBP1P09467 338 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG8P0DPA2 414 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LBPP18428 481 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH3A1P30838 453 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAR1BP31321 381 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRA5P31644 462 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MPV17P39210 176 aa6.57□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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