RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.91□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 POM121BA6NF01 834 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 CTSVO60911 334 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 NGFRP08138 427 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 SPP1P10451 314 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 C10orf90Q96M02 699 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 MRI1Q9BV20 369 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 CST11Q9H112 138 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 RGCCQ9H4X1 137 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 STK17BO94768 372 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 MPIG6BO95866 241 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 AK1P00568 194 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 CD14P08571 375 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 HTRA3P83110 453 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 GVQW1Q8N7I0 195 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 NUBPLQ8TB37 319 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 APOOQ9BUR5 198 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PBX4Q9BYU1 374 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 REG4Q9BYZ8 158 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 CES1P1Q9UKY3 287 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 NPY4RP50391 375 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PPP2CBP62714 309 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 PPP2CAP67775 309 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
USP25-201ENST00000285679 A8MXK9 166 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 CTDSPLO15194 276 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FGF19O95750 216 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 HCKP08631 526 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 GIMD1P0DJR0 217 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ADRA2CP18825 462 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 CPT2P23786 658 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 IL12BP29460 328 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FZD5Q13467 585 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 OR2L13Q8N349 312 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FAM3CQ92520 227 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FGF13Q92913 245 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 CCDC74AQ96AQ1 378 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.9□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 A0A0A6YYH2 397 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 A6NJ64 397 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TMEM212A6NML5 194 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SERPINF1P36955 418 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FAM53BQ14153 422 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC25A24Q6NUK1 477 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 HERVK_113Q902F9 699 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ZBP1Q9H171 429 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 CDH23Q9H251 3354 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 C2orf72A6NCS6 295 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 BRINP1O60477 761 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 AQP8O94778 261 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 JMJD7P0C870 316 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 CLINT1Q14677 625 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 AWAT2Q6E213 333 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC18B1Q6NT16 456 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 FGF11Q92914 225 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 LRRC3BQ96PB8 259 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 RAB19A4D1S5 217 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SULT1C2O00338 296 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TOMM20Q15388 145 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SHEQ5VZ18 495 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 MDGA2Q7Z553 956 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 TMEM52Q8NDY8 209 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 G6PC3Q9BUM1 346 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 PLXNA3P51805 1871 aa13.89□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 HRKO00198 91 aa13.88□□□□□ -0.19
USP25-201ENST00000285679 KLF4O43474 513 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms