RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265560.8

USP4-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP4, Length 3,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-201ENST00000265560 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 A6NIN4 97 aa14.66□□□□□ -0.06
USP4-201ENST00000265560 OGG1O15527 345 aa14.66□□□□□ -0.06
USP4-201ENST00000265560 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP4-201ENST00000265560 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 ZNF17P17021 662 aa14.65□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 NHLH1Q02575 133 aa14.65□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.65□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.65□□□□□ -0.06
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USP4-201ENST00000265560 TAS2R43P59537 309 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-201ENST00000265560 SLC17A1Q14916 467 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-201ENST00000265560 ZNF766Q5HY98 468 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-201ENST00000265560 MDS2Q8NDY4 140 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-201ENST00000265560 FNDC8Q8TC99 324 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-201ENST00000265560 MAP6Q96JE9 813 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-201ENST00000265560 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-201ENST00000265560 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-201ENST00000265560 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-201ENST00000265560 OR2M2Q96R28 347 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-201ENST00000265560 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.63□□□□□ -0.07
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