RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EMC3Q9P0I2 261 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MALT1Q9UDY8 824 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ING4Q9UNL4 249 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RASD1Q9Y272 281 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG5Q9Y673 324 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM30A4D0T7 59 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CTDSPLO15194 276 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HCRTR1O43613 425 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SULT1B1O43704 296 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD7O75084 574 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB6O75190 326 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NCR1O76036 304 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IL33O95760 270 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QBP02746 253 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CD14P08571 375 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UCHL1P09936 223 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C4BPBP20851 252 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 AHCYP23526 432 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 STOMP27105 288 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PPICP45877 212 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BLVRAP53004 296 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR12D2P58182 307 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FXYD6P3P58550 94 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PSG6Q00889 435 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF85Q03923 595 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DYRK1AQ13627 763 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TATDN3Q17R31 274 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 VASNQ6EMK4 673 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4K13Q8NH42 304 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPHQ8WWY8 451 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GHSRQ92847 366 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HYLS1Q96M11 299 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2M2Q96R28 347 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1F2PQ96R84 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LAT2Q9GZY6 243 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCG5Q9H222 651 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NANSQ9NR45 359 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NLKQ9UBE8 527 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG8Q9UK08 70 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA2Q9UM82 520 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MEMO1Q9Y316 297 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG2Q9Y698 323 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GVI7 797 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRG6 482 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FITM1A5D6W6 292 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FRG2CA6NGY1 282 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf105B2RV13 164 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 XKRYO14609 159 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF264O43296 627 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SSX4O60224 188 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAF2O60831 178 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SC5DO75845 299 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2B3O76000 313 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NTN1O95631 604 aa6.31□□□□□ -1.4
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