RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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LMO2-201ENST00000257818 ACHEP22303 614 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 BTG2P78543 158 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 RAB11BQ15907 218 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 ST8SIA2Q92186 375 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 KCNG2Q9UJ96 466 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO2-201ENST00000257818 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 CCKBRP32239 447 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 CCR4P51679 360 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 STARD6P59095 220 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 FAM74A1Q5RGS3 127 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 INTS14Q96SY0 518 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 SYT4Q9H2B2 425 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 IFT46Q9NQC8 304 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 MELTFP08582 738 aa22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 FAM166AQ6J272 317 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.26■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 WDPCPO95876 746 aa22.25■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 C17orf107Q6ZR85 190 aa22.25■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 GKN2Q86XP6 184 aa22.25■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 OR10A5Q9H207 317 aa22.25■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 RASL12Q9NYN1 266 aa22.25■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 TMEM82A0PJX8 343 aa22.24■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 DGAT2Q96PD7 388 aa22.24■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 SLC25A28Q96A46 364 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 WNT16Q9UBV4 365 aa22.23■■□□□ 1.15
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LMO2-201ENST00000257818 MAOAP21397 527 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 TAS2R19P59542 299 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 ACTBP60709 375 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 ACTG1P63261 375 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 ZNF615Q8N8J6 731 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 OR1J4Q8NGS1 313 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 CCDC107Q8WV48 283 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO2-201ENST00000257818 TMEM131Q92545 1883 aa22.23■■□□□ 1.15
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