RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052965.6

Nipbl-201, Transcript of Nipped-B-like protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nipbl, Length 8,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1436A0PK57 315 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Arntl2Q2VPD4 579 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 PdhxQ8BKZ9 501 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Slc35c1Q8BLX4 363 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1423Q8VFV0 310 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Ttll2A4Q9E4 540 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Gm5239D3YYZ2 122 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Vmn2r13L7N1X2 831 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 DffbO54788 344 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 AanatO88816 205 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 ArsbP50429 534 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 FapP97321 761 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 CrxosQ3UL53 246 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Itpripl2Q3UV16 535 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 CstbQ62426 98 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Sec22aQ8BH47 307 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1263Q8VG63 306 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Adgrl4Q923X1 739 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 RragcQ99K70 398 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Heatr5bQ8C547 2070 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr576A0A0G2JFH3 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Prr32A2AFE9 284 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Morn1A2RTS7 477 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Gm21812J3QN84 227 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 P01652 108 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 FlgP11088 336 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Isg20l2Q3U1G5 368 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Pck2Q8BH04 640 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 9230113P08RikD3YWX3 137 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Cldn20G5E8X0 219 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr329-psM9MMK4 331 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Mapk15Q80Y86 549 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 CebpzosQ8BTE5 80 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Ubqln3Q8C5U9 658 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Flywch1Q8CI03 673 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr53Q8VGL8 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 HraslsQ9QZU4 167 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Angpt4Q9WVH6 509 aa9.96□□□□□ -0.81
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Gm8225D3Z536 292 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 EbpP70245 230 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Usp22Q5DU02 525 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Hsh2dQ6VYH9 334 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Slc16a12Q8BGC3 486 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Cfap20Q8BTU1 193 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1297Q8VGE8 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr338Q8VGK6 306 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Syt7Q9R0N7 403 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Zfp944E9PUS4 492 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Fut4Q11127 433 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Tle1Q62440 770 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 LipkQ8BM14 398 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr473Q8VG44 310 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Ceacam18Q9D871 376 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 RetnlaQ9EP95 111 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Sgk3Q9ERE3 496 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Angptl4Q9Z1P8 410 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Gm17669F6QL70 154 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 P06336 421 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 CtnsP57757 367 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Npas1P97459 594 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Npy6rQ61212 371 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 ArsjQ8BM89 598 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Med19Q8C1S0 244 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Cmtm4Q8CJ61 208 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr837Q8VFJ4 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr410Q8VFX7 315 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr402Q8VFX8 315 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Pdzd3Q99MJ6 498 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Scp2d1Q9DAH1 156 aa9.96□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Grk6O70293 576 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Tpi1P17751 299 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 PfkmP47857 780 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Lhx3P50481 400 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 KhkP97328 298 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1166Q7TR27 316 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1254Q8VFB1 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr472Q8VG43 310 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Minpp1Q9Z2L6 481 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr115B2RTB9 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 OmgQ63912 440 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr506Q7TRU6 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr350Q8VFP8 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Acss2Q9QXG4 701 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr1320A2AHM8 319 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Olfr891E9Q843 316 aa9.95□□□□□ -0.82
Nipbl-201ENSMUST00000052965 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.6 ms