RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639051.1

ZNF410-225, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5 BASIC

Gene ZNF410, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-225	ENST00000639051	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	GPATCH3	Q96I76	525 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	CIAO1	O76071	339 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	ST5	P78524	1137 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	EVX2	Q03828	476 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	NFIX	Q14938	502 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	SMIM5	Q71RC9	77 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	SIL1	Q9H173	461 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	EYA2	O00167	538 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	ITGA6	P23229	1130 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	PDE4A	P27815	886 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	AOX1	Q06278	1338 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ZNF410-225	ENST00000639051	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	MX1	P20591	662 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	GREM2	Q9H772	168 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SERPINB2	P05120	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TM4SF1	P30408	202 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	AACS	Q86V21	672 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ERC2	O15083	957 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SASH1	O94885	1247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ZNF609	O15014	1411 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	PDE1A	P54750	535 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TFCP2	Q12800	502 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	MMP10	P09238	476 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	DDR1	Q08345	913 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	LRRC24	Q50LG9	513 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	FSTL1	Q12841	308 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ZNF410-225	ENST00000639051	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	FOXN1	O15353	648 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	CDC45	O75419	566 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	PDE6B	P35913	854 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZNF410-225	ENST00000639051	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.39	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms