RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	CALM1	P0DP23	149 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CALM2	P0DP24	149 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CALM3	P0DP25	149 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CYP2C19	P33261	490 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	IL13	P35225	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PRPH	P41219	470 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	AMPH	P49418	695 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ST5	P78524	1137 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CFAP58	Q5T655	872 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RNF214	Q8ND24	703 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	HYPK	Q9NX55	129 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NAA25	Q14CX7	972 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	INCENP	Q9NQS7	918 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NFAT5	O94916	1531 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CEP89	Q96ST8	783 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8	2e-7	■■■■□ 19.7
CACNB4-222	ENST00000636350	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PFKFB2	O60825	505 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC8A1	P32418	973 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CLCN2	P51788	898 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TERF2	Q15554	542 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	STK36	Q9NRP7	1315 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SYCE3	A1L190	88 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TYRO3	Q06418	890 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	MBIP	Q9NS73	344 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	EID1	Q9Y6B2	187 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	STIM1	Q13586	685 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	STK38	Q15208	465 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CUEDC2	Q9H467	287 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP6R2	O75170	966 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	FLOT1	O75955	427 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ERLIN2	O94905	339 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NLRP12	P59046	1061 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	BATF3	Q9NR55	127 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ABCB11	O95342	1321 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SLIT1	O75093	1534 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	KDR	P35968	1356 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ENO4	A6NNW6	628 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SDS	P20132	328 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CUTA	O60888	179 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	RTL9	Q8NET4	1388 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SRGAP3	O43295	1099 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	CP	P00450	1065 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC4A3	P48751	1232 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF165	P49910	485 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CACNB4-222	ENST00000636350	NBPF14	Q5TI25	921 aa		3.79	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms