RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	GNRH1	P01148	92 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRK4	P32298	578 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	NLRP13	Q86W25	1043 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	IFNL1	Q8IU54	200 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABTB2	Q8N961	1025 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRIM47	Q96LD4	638 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	NSD2	O96028	1365 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPTA1	P02549	2419 aa		3.61	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	C5	P01031	1676 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDM4A	O75164	1064 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAP1	Q01518	475 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	DDR1	Q08345	913 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF22	Q14807	665 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF605	Q86T29	641 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	FBXL6	Q8N531	539 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	TIFA	Q96CG3	184 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CLMP	Q9H6B4	373 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	STK26	Q9P289	416 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	C4B	P0C0L5	1744 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLXNA3	P51805	1871 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	TCIRG1	Q13488	830 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNKSR1	Q969H4	720 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	FLT4	P35916	1363 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		3.59	□□□□□ -1.83
HS1BP3-208	ENST00000631166	MRC1	P22897	1456 aa		3.59	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166		E9PCH4	1651 aa		3.59	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	POLQ	O75417	2590 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	CREBBP	Q92793	2442 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166		J3QKU1	62 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	C8B	P07358	591 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	TM4SF1	P30408	202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	AVPR2	P30518	371 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	CRHR2	Q13324	411 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	FKBP8	Q14318	412 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC93	Q567U6	631 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAET1E	Q8TD07	263 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	HINFP	Q9BQA5	517 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	TJP1	Q07157	1748 aa		3.58	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.57	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.57	□□□□□ -1.84
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMEM221	A6NGB7	291 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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