RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA0232Q92628 1395 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 RELBQ01201 579 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 GAS6Q14393 721 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 KCNH5Q8NCM2 988 aa10.42□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 PLIN1O60240 522 aa10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 ADAM23O75077 832 aa10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 RNF217Q8TC41 542 aa10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP45Q92619 1136 aa10.41□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 LILRB3O75022 631 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 BCAR3O75815 825 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 ITGB2P05107 769 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K10Q02779 954 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.4□□□□□ -0.74
CTXN3-204ENST00000620385 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF853P0CG23 659 aa10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.39□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 MSTNO14793 375 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 DCAF5Q96JK2 942 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.38□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 USP19O94966 1318 aa10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 HMOX1P09601 288 aa10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 AMPHP49418 695 aa10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 HOXC9P31274 260 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K5Q99683 1374 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ABTB2Q8N961 1025 aa10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC4O15439 1325 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 PTPRCP08575 1304 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 CRB1P82279 1406 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 PROCP04070 461 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM27P14373 513 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 MSH6P52701 1360 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 STRCQ7RTU9 1775 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-204ENST00000620385 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM66O15016 1216 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 C14orf37Q86TY3 774 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 IP6K1Q92551 441 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 MBIPQ9NS73 344 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 COG6Q9Y2V7 657 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA3Q99758 1704 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 PSME1Q06323 249 aa10.32□□□□□ -0.76
CTXN3-204ENST00000620385 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.4 ms