RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA32Q96LK8 384 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SIL1Q9H173 461 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CEP83Q9Y592 693 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC172P0C7W6 258 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ACTN2P35609 894 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CTR9Q6PD62 1173 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 DDX11Q96FC9 970 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 EP400Q96L91 3159 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FANCGO15287 622 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 STK3Q13188 491 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 RNF20Q5VTR2 975 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TMC6Q7Z403 805 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ATP10DQ9P241 1426 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SMC2O95347 1197 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FLIIQ13045 1269 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ANAPC15P60006 121 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ST3GAL1Q11201 340 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC93Q567U6 631 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 NBPF4Q96M43 638 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEA9P43362 315 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 IQCB1Q15051 598 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PROSER3Q2NL68 480 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PGBD1Q96JS3 809 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SUFUQ9UMX1 484 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA4P34932 840 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TTC14Q96N46 770 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TNRQ92752 1358 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TADA3O75528 432 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ME3Q16798 604 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM5Q71RC9 77 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0232Q92628 1395 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 MNAT1P51948 309 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 IL17REQ8NFR9 667 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 LIG3P49916 1009 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 NBPF11Q86T75 865 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 FUT8Q9BYC5 575 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 IFNKQ9P0W0 207 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRUQ92729 1446 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 BIN1O00499 593 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 TDO2P48775 406 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 ATP8B2P98198 1209 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-211ENST00000618610 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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