RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594537.2

LTBP4-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene LTBP4, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-211ENST00000594537 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-211ENST00000594537 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-211ENST00000594537 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-211ENST00000594537 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-211ENST00000594537 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-211ENST00000594537 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 SPEF2Q9C093 1822 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 SNED1Q8TER0 1413 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 XDHP47989 1333 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 GRIN3BO60391 1043 aa28.68■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 MPNDQ8N594 471 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 PSMD1Q99460 953 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 CHRNDQ07001 517 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 GPR162Q16538 588 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 LRRC24Q50LG9 513 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 SIL1Q9H173 461 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 VPS33BQ9H267 617 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 RAB11FIP3O75154 756 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 ATP2B4P23634 1241 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 METTL24Q5JXM2 366 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-211ENST00000594537 LTBP1Q14766 1721 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 DCTPP1Q9H773 170 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 PDE8BO95263 885 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 GPSM2P81274 684 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 GGA1Q9UJY5 639 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 UBE4AQ14139 1066 aa28.61■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.61■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 A0A1B0GUL6 1792 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 OLFM4Q6UX06 510 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 GCC1Q96CN9 775 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 EYA3Q99504 573 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 GPR108Q9NPR9 543 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.59■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.59■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 NFKBIEO00221 500 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-211ENST00000594537 UFL1O94874 794 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 SASH1O94885 1247 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 KCNJ4P48050 445 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 POLLQ9UGP5 575 aa28.56■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 MED23Q9ULK4 1368 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 C6orf229H3BNL8 230 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 TAF5LO75529 589 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 LPIN2Q92539 896 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 FGFR2P21802 821 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 TFCP2Q12800 502 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 SLC51AQ86UW1 340 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 SMC5Q8IY18 1101 aa28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 SLC5A1P13866 664 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 ATP2B3Q16720 1220 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 WASHC4Q2M389 1173 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-211ENST00000594537 LMNB1P20700 586 aa28.51■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 IGHDP01880 384 aa28.5■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 ZNF609O15014 1411 aa28.5■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.49■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 TNNI3KQ59H18 835 aa28.49■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.49■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 ZBTB22O15209 634 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 PPIP5K2O43314 1243 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP4-211ENST00000594537 RASSF7Q02833 373 aa28.48■■■□□ 2.15
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