RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 RIMBP2O15034 1052 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 VIL1P09327 827 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 ZNF609O15014 1411 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 FKBP1BP68106 108 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 GPSM2P81274 684 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 DOK7Q18PE1 504 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 NECTIN2Q92692 538 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 C6orf229H3BNL8 230 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 ZNF428Q96B54 188 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 GCC1Q96CN9 775 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-211ENST00000592658 TBC1D8O95759 1140 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 RIPK4P57078 832 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 TBC1D16Q8TBP0 767 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 EYA3Q99504 573 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.33■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 SCARF1Q14162 830 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 KRT24Q2M2I5 525 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 TM4SF4P48230 202 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 GPR25O00155 361 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 MOB2Q70IA6 237 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 PSME4Q14997 1843 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 FAM89AQ96GI7 184 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 GMLQ99445 158 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 CFHR5Q9BXR6 569 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.28■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 RPS8P62241 208 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.27■□□□□ 0.36
CTIF-211ENST00000592658 SZT2Q5T011 3432 aa17.27■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 CHL1O00533 1208 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.26■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 FKTNO75072 461 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 UFL1O94874 794 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 USP17L8P0C7I0 530 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.25■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 GGA1Q9UJY5 639 aa17.24■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 SREBF2Q12772 1141 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 NEUROD2Q15784 382 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 SEC31BQ9NQW1 1179 aa17.23■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 POTEFA5A3E0 1075 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 G3V3G9 751 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.22■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 HOXB7P09629 217 aa17.21■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.35
CTIF-211ENST00000592658 USP17L3A6NCW0 530 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 USP17L4A6NCW7 530 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 PODNQ7Z5L7 613 aa17.2■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 WNT10BO00744 389 aa17.19■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 RALBP1Q15311 655 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 SPRYD7Q5W111 196 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 HYPKQ9NX55 129 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 XDHP47989 1333 aa17.18■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 ALDH1A1P00352 501 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 NF2P35240 595 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 DACT2Q5SW24 774 aa17.17■□□□□ 0.34
CTIF-211ENST00000592658 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms