RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	ECE2	O60344	883 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	CSF1R	P07333	972 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	ITGA6	P23229	1130 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM161A	Q3B820	660 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPRC	P08575	1304 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
PTPRS-209	ENST00000591760	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	GRM8	O00222	908 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP2B4	P23634	1241 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760		G3V3G9	751 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	PSMD14	O00487	310 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	FOXO4	P98177	505 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PTPRS-209	ENST00000591760	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	MED23	Q9ULK4	1368 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	DPF2	Q92785	391 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	MIER1	Q8N108	512 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	PSME4	Q14997	1843 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760		H7C1D1	291 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	PODN	Q7Z5L7	613 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	UTY	O14607	1347 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF609	O15014	1411 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	CHRND	Q07001	517 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	KCNJ4	P48050	445 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTPRS-209	ENST00000591760	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	USP17L3	A6NCW0	530 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	USP17L4	A6NCW7	530 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	PCNT	O95613	3336 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78

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