RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-211	ENST00000590874	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	MYD88	Q99836	296 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	APAF1	O14727	1248 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	CA12	O43570	354 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	HUNK	P57058	714 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZIC5	Q96T25	663 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	ADM5	C9JUS6	153 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
CAPNS1-211	ENST00000590874	UFL1	O94874	794 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	GNAI1	P63096	354 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	NOG	Q13253	232 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	GGA1	Q9UJY5	639 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	FAM161A	Q3B820	660 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	SCN9A	Q15858	1988 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	PDE8A	O60658	829 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	RGMB	Q6NW40	437 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874	GGA3	Q9NZ52	723 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPNS1-211	ENST00000590874		G3V3G9	751 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZNF609	O15014	1411 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	SULF1	Q8IWU6	871 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	XDH	P47989	1333 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CAPNS1-211	ENST00000590874	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	IGKV5-2	P06315	115 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	CTSW	P56202	376 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	DGKZ	Q13574	1117 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	SCARF1	Q14162	830 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	GML	Q99445	158 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	ATP2B4	P23634	1241 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	RGS19	P49795	217 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	SLC10A3	P09131	477 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CAPNS1-211	ENST00000590874	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	PSME4	Q14997	1843 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	USP17L3	A6NCW0	530 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	USP17L4	A6NCW7	530 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	PODN	Q7Z5L7	613 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	GREM2	Q9H772	168 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	MED23	Q9ULK4	1368 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	TRPA1	O75762	1119 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CAPNS1-211	ENST00000590874	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.95	■■■□□ 2.87

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