RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589254.1

USP36-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 3

Gene USP36, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-215ENST00000589254 WASHC4Q2M389 1173 aa14.95□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 MIER1Q8N108 512 aa14.95□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 NUDCQ9Y266 331 aa14.95□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.94□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.94□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.93□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 C6orf229H3BNL8 230 aa14.93□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 KRT24Q2M2I5 525 aa14.93□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 COPS6Q7L5N1 327 aa14.93□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 ERBB4Q15303 1308 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 CENPFP49454 3210 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 POTEFA5A3E0 1075 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 SCARF1Q14162 830 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 RALBP1Q15311 655 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 SULF1Q8IWU6 871 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 BRCA2P51587 3418 aa14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 TCIRG1Q13488 830 aa14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 FAM89AQ96GI7 184 aa14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.91□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 SPEF2Q9C093 1822 aa14.9□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 GPR25O00155 361 aa14.9□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 NFE2L2Q16236 605 aa14.9□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP36-215ENST00000589254 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.89□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 MXD3Q9BW11 206 aa14.89□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.89□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.89□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 FZD1Q9UP38 647 aa14.89□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 CAP1Q01518 475 aa14.88□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 GMLQ99445 158 aa14.88□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 CCER2I3L3R5 266 aa14.87□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.86□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.86□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 ZNF609O15014 1411 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 UFL1O94874 794 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 TM4SF4P48230 202 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 PRKG1Q13976 671 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 TMC4Q7Z404 712 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 SZT2Q5T011 3432 aa14.85□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 LAMB1P07942 1786 aa14.84□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 EYA3Q99504 573 aa14.84□□□□□ -0.03
USP36-215ENST00000589254 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.83□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 FKTNO75072 461 aa14.83□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 FKBP1BP68106 108 aa14.83□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.82□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 SASH1O94885 1247 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 USP17L8P0C7I0 530 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 GCC1Q96CN9 775 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 MRS2Q9HD23 443 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 TRIM17Q9Y577 477 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.81□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 CCDC184Q52MB2 194 aa14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 GGA1Q9UJY5 639 aa14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 CEP290O15078 2479 aa14.8□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 WNT10BO00744 389 aa14.79□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 RIPK4P57078 832 aa14.79□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.79□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 OTOFQ9HC10 1997 aa14.79□□□□□ -0.04
USP36-215ENST00000589254 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms