RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 RTL9Q8NET4 1388 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM89AQ96GI7 184 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-205ENST00000588780 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RIPK4P57078 832 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 SCARF1Q14162 830 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D8O95759 1140 aa28.48■■■□□ 2.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 UFL1O94874 794 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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CAPNS1-205ENST00000588780 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-205ENST00000588780 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 MOB2Q70IA6 237 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 GGA1Q9UJY5 639 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT24Q2M2I5 525 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 USP17L8P0C7I0 530 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 GCC1Q96CN9 775 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SCN9AQ15858 1988 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR25O00155 361 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 NEUROD2Q15784 382 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 NF2P35240 595 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 COL4A1P02462 1669 aa28.35■■■□□ 2.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 FKTNO75072 461 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 SREBF2Q12772 1141 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXW7Q969H0 707 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-205ENST00000588780 TM4SF4P48230 202 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 HYPKQ9NX55 129 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PRKG1Q13976 671 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 OGFOD1Q8N543 542 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 XDHP47989 1333 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 CHL1O00533 1208 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PODNQ7Z5L7 613 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA2Q08379 1002 aa28.28■■■□□ 2.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 HOXB7P09629 217 aa28.25■■■□□ 2.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 MXD3Q9BW11 206 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM17Q9Y577 477 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 WNT10BO00744 389 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 SASH1O94885 1247 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 ALDH1A1P00352 501 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-205ENST00000588780 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.22■■■□□ 2.11
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