RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	SNED1	Q8TER0	1413 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	GPSM2	P81274	684 aa		31.14	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		31.14	■■■□□ 2.58
GPS1-223	ENST00000584229	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	LMNB1	P20700	586 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		31.13	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD1	Q99460	953 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	SRGAP3	O43295	1099 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	XDH	P47989	1333 aa		31.1	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	UFL1	O94874	794 aa		31.09	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	PRELP	P51888	382 aa		31.08	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.08	■■■□□ 2.57
GPS1-223	ENST00000584229	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.07	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	CHRND	Q07001	517 aa		31.07	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	SIL1	Q9H173	461 aa		31.07	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ4	P48050	445 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	AOC3	Q16853	763 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	YY1	P25490	414 aa		31.05	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.05	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC24	Q50LG9	513 aa		31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	EYA3	Q99504	573 aa		31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	TAF5L	O75529	589 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	ATP2B4	P23634	1241 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	MTX1	Q13505	466 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.03	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.02	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	METTL24	Q5JXM2	366 aa		31.02	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.02	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		31.02	■■■□□ 2.56
GPS1-223	ENST00000584229	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	COL4A5	P29400	1685 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229		G3V3G9	751 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	EYA2	O00167	538 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	ATP8B2	P98198	1209 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	CEP85	Q6P2H3	762 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	VPS33B	Q9H267	617 aa		30.97	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	COPRS	Q9NQ92	184 aa		30.97	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	SNAP23	O00161	211 aa		30.95	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		30.95	■■■□□ 2.55
GPS1-223	ENST00000584229	MED23	Q9ULK4	1368 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	CIAO1	O76071	339 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	DOK7	Q18PE1	504 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	SSH3	Q8TE77	659 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO3	Q9UK99	471 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	30.93	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	POLA2	Q14181	598 aa		30.93	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		30.93	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	30.92	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		30.92	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	HMMR	O75330	724 aa		30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	KLRK1	P26718	216 aa		30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		30.91	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	PSME4	Q14997	1843 aa		30.9	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ECE2	O60344	883 aa		30.9	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	PDE8B	O95263	885 aa		30.9	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		30.9	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		30.9	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	SCN9A	Q15858	1988 aa		30.89	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		30.89	■■■□□ 2.54
GPS1-223	ENST00000584229	UBE4A	Q14139	1066 aa		30.88	■■■□□ 2.53
GPS1-223	ENST00000584229	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	30.88	■■■□□ 2.53
GPS1-223	ENST00000584229	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		30.88	■■■□□ 2.53
GPS1-223	ENST00000584229	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		30.88	■■■□□ 2.53

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