RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 RTN1Q16799 776 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS2O95450 1211 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 BMP15O95972 392 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 SYT1P21579 422 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 RTL1A6NKG5 1358 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA4P34932 840 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 FSD2A1L4K1 749 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 SAMM50Q9Y512 469 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 TMTC2Q8N394 836 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 TNNQ9UQP3 1299 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CYP7A1P22680 504 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DOAP06340 250 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY3P0CV98 308 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY8P0CW00 308 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 GRM8O00222 908 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TYRO3Q06418 890 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ESR2Q92731 530 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 DRC1Q96MC2 740 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 STX8Q9UNK0 236 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH1L1O75891 902 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 GSTO1P78417 241 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CABP5Q9NP86 173 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D5Q92609 795 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2C2O75185 946 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA24Q86W54 205 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SPAG1Q07617 926 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2B3Q16720 1220 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC172P0C7W6 258 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 AK2P54819 239 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 WDR78Q5VTH9 848 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 COPS6Q7L5N1 327 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 FEZ1Q99689 392 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN2AQ12879 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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PTPRM-211ENST00000580170 SPAG5Q96R06 1193 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SPTLC2O15270 562 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PTGS1P23219 599 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ERMNQ8TAM6 284 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 KSR2Q6VAB6 950 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 DHX58Q96C10 678 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 MCM6Q14566 821 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE9A4FU28 777 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CEP85Q6P2H3 762 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC174Q6PII3 467 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 BICD1Q96G01 975 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 FANCAO15360 1455 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 PSMA7O14818 248 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA2Q15822 529 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRM-211ENST00000580170 ASIC1P78348 528 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 MAPKBP1O60336 1514 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 DCTPP1Q9H773 170 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RLBP1P12271 317 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A6Q13433 755 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA1Q92805 767 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 TACC1O75410 805 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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