RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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CCDC40-211ENST00000574099 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 SULF1Q8IWU6 871 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 EYA3Q99504 573 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 SLC10A3P09131 477 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 NEUROD2Q15784 382 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 CDCA5Q96FF9 252 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 CSRNP1Q96S65 589 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 G3V3G9 751 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.87■■□□□ 1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 UFL1O94874 794 aa22.86■■□□□ 1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 PSME4Q14997 1843 aa22.85■■□□□ 1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 CHL1O00533 1208 aa22.84■■□□□ 1.25
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CCDC40-211ENST00000574099 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 SCARF1Q14162 830 aa22.83■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCDC40-211ENST00000574099 GGA1Q9UJY5 639 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 MOB2Q70IA6 237 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 HYPKQ9NX55 129 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF609O15014 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 HOXB7P09629 217 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 SPEF2Q9C093 1822 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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CCDC40-211ENST00000574099 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.77■■□□□ 1.24
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D8O95759 1140 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L8P0C7I0 530 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 FKBP1BP68106 108 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 GOLGA2Q08379 1002 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 MYD88Q99836 296 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.75■■□□□ 1.23
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CCDC40-211ENST00000574099 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.75■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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CCDC40-211ENST00000574099 GMLQ99445 158 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 XDHP47989 1333 aa22.74■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L3A6NCW0 530 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L4A6NCW7 530 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 RALBP1Q15311 655 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 RUNDC1Q96C34 613 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 MBIPQ9NS73 344 aa22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 PDE8AO60658 829 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 MXD3Q9BW11 206 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 FBXW7Q969H0 707 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC40-211ENST00000574099 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 ATP2B4P23634 1241 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 PODNQ7Z5L7 613 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 GPR25O00155 361 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 MYH3P11055 1940 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 MED23Q9ULK4 1368 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCDC40-211ENST00000574099 SASH1O94885 1247 aa22.67■■□□□ 1.22
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