RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 POLIQ9UNA4 740 aa7.24□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 H3BRB1 525 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 J3QW42 95 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 SOX18P35713 384 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 C8orf34Q49A92 452 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 PERM1Q5SV97 790 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 TTC16Q8NEE8 873 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 ELP3Q9H9T3 547 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 A6NHS1 94 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 FZD6O60353 706 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 NID1P14543 1247 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 SIK1P57059 783 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 OR13H1Q8NG92 308 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.22□□□□□ -1.25
TMOD2-205ENST00000561300 BRD1O95696 1058 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 ITGB7P26010 798 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CD163Q86VB7 1156 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 ECM1Q16610 540 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 XKR5Q6UX68 686 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CNTN3Q9P232 1028 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 GHRHP01286 108 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 USP5P45974 858 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 HYAL2Q12891 473 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 DOC2BQ14184 412 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 PLD4Q96BZ4 506 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CHRNA4P43681 627 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 GRIK5Q16478 980 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TTC9Q92623 222 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 RBSNQ9H1K0 784 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 FAM229AH3BQW9 127 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 ARHGAP4P98171 946 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 EHHADHQ08426 723 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 GJD3Q8N144 294 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SPACA7Q96KW9 195 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 BTBD11A6QL63 1104 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 KIF4AO95239 1232 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CES1P23141 567 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 MSL1Q68DK7 614 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 TNFRSF21O75509 655 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 ATP11AP98196 1134 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 CHRDQ9H2X0 955 aa7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD2-205ENST00000561300 A0A0A0MRY4 1105 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 NDUFB5O43674 189 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 PHACTR2O75167 634 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 RAC1P63000 192 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 ILDR2Q71H61 639 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 CEP120Q8N960 986 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 PMEPA1Q969W9 287 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 EREGO14944 169 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 CEP135Q66GS9 1140 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 PBX4Q9BYU1 374 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TMOD2-205ENST00000561300 ACPPP15309 386 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms