RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 WDR90Q96KV7 1748 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 XDHP47989 1333 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 UFL1O94874 794 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 C6orf229H3BNL8 230 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 PANK1Q8TE04 598 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 VPS33BQ9H267 617 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 GGA1Q9UJY5 639 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 GLTPD2A6NH11 291 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 FZD9O00144 591 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLIN1O60240 522 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 GNAI3P08754 354 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 JDP2Q8WYK2 163 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCN9AQ15858 1988 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 PSME4Q14997 1843 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHRNDQ07001 517 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 NIM1KQ8IY84 436 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-209ENST00000561191 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 WASHC4Q2M389 1173 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIMBP2O15034 1052 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP2B4P23634 1241 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 EYA3Q99504 573 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 MED23Q9ULK4 1368 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 YDJCA8MPS7 323 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCN4AP35499 1836 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 TAF5LO75529 589 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 GNAI2P04899 355 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 KLRK1P26718 216 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRRC24Q50LG9 513 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 SNAP23O00161 211 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF3CO14782 793 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 MTX1Q13505 466 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-209ENST00000561191 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 ECE2O60344 883 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 MS4A1P11836 297 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 DOK7Q18PE1 504 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 POTECB2RU33 542 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 CXCL9Q07325 125 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPC2Q8N158 579 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 RRAGCQ9HB90 399 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 COG6Q9Y2V7 657 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 SRGAP3O43295 1099 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 RAD17O75943 681 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 KCNJ4P48050 445 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 EYA2O00167 538 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 PDE3AQ14432 1141 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIL1Q9H173 461 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 METTL24Q5JXM2 366 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 COPRSQ9NQ92 184 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.14■■□□□ 1.3
USP3-AS1-209ENST00000561191 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-209ENST00000561191 PSMD14O00487 310 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms