RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 H7C1D1 291 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP2K2P36507 400 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 WASHC4Q2M389 1173 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 F6X3S4 739 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 DPF2Q92785 391 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 EYA3Q99504 573 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF1P21675 1872 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 GRM1Q13255 1194 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 YDJCA8MPS7 323 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 COL4A1P02462 1669 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 C6orf229H3BNL8 230 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 LINS1Q8NG48 757 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CA12O43570 354 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 BEND3Q5T5X7 828 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 MICALL2Q8IY33 904 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 H7C1W4 665 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 GCKRQ14397 625 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CASP7P55210 303 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 PSMD14O00487 310 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 GPSM2P81274 684 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 POLLQ9UGP5 575 aa25.44■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 RIMBP2O15034 1052 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ECE2O60344 883 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 PDE8AO60658 829 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH3P11055 1940 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRCP08575 1304 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 G3V3G9 751 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 AOC2O75106 756 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 USP48Q86UV5 1035 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ABHD8Q96I13 439 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 NOGQ13253 232 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-210ENST00000559586 SHTN1A0MZ66 631 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 DOK7Q18PE1 504 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 GGA1Q9UJY5 639 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 ALDH1L1O75891 902 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 CTSWP56202 376 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 HUNKP57058 714 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 UFL1O94874 794 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 RTL9Q8NET4 1388 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 GRM8O00222 908 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.34■■□□□ 1.65
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