RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 COL4A5P29400 1685 aa23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 GPSM2P81274 684 aa23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 VPS33BQ9H267 617 aa23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RABGGTA-208ENST00000558954 PPIP5K2O43314 1243 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 PANK1Q8TE04 598 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.63■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 JDP2Q8WYK2 163 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 GGA1Q9UJY5 639 aa23.62■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 C6orf229H3BNL8 230 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 PLIN1O60240 522 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 UFL1O94874 794 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 AOC3Q16853 763 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 EYA3Q99504 573 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR90Q96KV7 1748 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN4AP35499 1836 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN9AQ15858 1988 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 GNAI2P04899 355 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 NIM1KQ8IY84 436 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 POLLQ9UGP5 575 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.59■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.59■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2B4P23634 1241 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRNDQ07001 517 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE3AQ14432 1141 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 WASHC4Q2M389 1173 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 MED23Q9ULK4 1368 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 FZD9O00144 591 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 MTX1Q13505 466 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 GLTPD2A6NH11 291 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNJ4P48050 445 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 COG6Q9Y2V7 657 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 RIMBP2O15034 1052 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 SRGAP3O43295 1099 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO3Q9UK99 471 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF5LO75529 589 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 G3V3G9 751 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 EYA2O00167 538 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC24Q50LG9 513 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL24Q5JXM2 366 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 GPC2Q8N158 579 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.5■■□□□ 1.35
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RABGGTA-208ENST00000558954 SIL1Q9H173 461 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 YDJCA8MPS7 323 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE4AQ14139 1066 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 DOK7Q18PE1 504 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 CXCL9Q07325 125 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE8BO95263 885 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRK1P26718 216 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP8B2P98198 1209 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-208ENST00000558954 TNIP1Q15025 636 aa23.45■■□□□ 1.34
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