RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C6orf229H3BNL8 230 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPSM2P81274 684 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CEP85Q6P2H3 762 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC51AQ86UW1 340 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIL1Q9H173 461 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHD4Q14839 1912 aa8.75□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EYA2O00167 538 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HMMRO75330 724 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEFLP07196 543 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNJ4P48050 445 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RASSF7Q02833 373 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHRNDQ07001 517 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AAMPQ13685 434 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRC24Q50LG9 513 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 METTL24Q5JXM2 366 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SSH3Q8TE77 659 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COPRSQ9NQ92 184 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XDHP47989 1333 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A1B0GUL6 1792 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NFKBIEO00221 500 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TAF5LO75529 589 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UFL1O94874 794 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POLA2Q14181 598 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PSMD1Q99460 953 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GGA1Q9UJY5 639 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FBXO3Q9UK99 471 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 G3V3G9 751 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIMBP2O15034 1052 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CIAO1O76071 339 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LMNB1P20700 586 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP2B4P23634 1241 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WASHC4Q2M389 1173 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EYA3Q99504 573 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POLLQ9UGP5 575 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTBP1Q14766 1721 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPIP5K2O43314 1243 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDE8BO95263 885 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 JDP2Q8WYK2 163 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RNF181Q9P0P0 153 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNED1Q8TER0 1413 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SNAP23O00161 211 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 APBB1O00213 710 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TFCP2Q12800 502 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBE4AQ14139 1066 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AOC3Q16853 763 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NIM1KQ8IY84 436 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VPS33BQ9H267 617 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SASH1O94885 1247 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC5A1P13866 664 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRELPP51888 382 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATP2B3Q16720 1220 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DOK7Q18PE1 504 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms