RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557400.5

NEDD1-210, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 604 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-210ENST00000557400 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 HUNKP57058 714 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 GNAI1P63096 354 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 NOGQ13253 232 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 TAF1P21675 1872 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 APAF1O14727 1248 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 DLK2Q6UY11 383 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 MYD88Q99836 296 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 UFL1O94874 794 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 GGA1Q9UJY5 639 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 ADM5C9JUS6 153 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 G3V3G9 751 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 PDE8AO60658 829 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 ZIC5Q96T25 663 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-210ENST00000557400 RGMBQ6NW40 437 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 SULF1Q8IWU6 871 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 GGA3Q9NZ52 723 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 FAM161AQ3B820 660 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF609O15014 1411 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC102AQ96A19 550 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 XDHP47989 1333 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 ATP2B4P23634 1241 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 CTSWP56202 376 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-210ENST00000557400 RGS19P49795 217 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 DGKZQ13574 1117 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 TSPYL6Q8N831 410 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 CDCA5Q96FF9 252 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 GMLQ99445 158 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 IGKV5-2P06315 115 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 SCARF1Q14162 830 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 KSR2Q6VAB6 950 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 PODNQ7Z5L7 613 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 USP17L3A6NCW0 530 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 USP17L4A6NCW7 530 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 SLC10A3P09131 477 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 USP17L8P0C7I0 530 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 SCN9AQ15858 1988 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 STK31Q9BXU1 1019 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 GREM2Q9H772 168 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 MED23Q9ULK4 1368 aa21.97■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 FKBP1BP68106 108 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 RNF186Q9NXI6 227 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD1-210ENST00000557400 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 TRPA1O75762 1119 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 CSRNP1Q96S65 589 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NEDD1-210ENST00000557400 CCDC27Q2M243 656 aa21.93■■□□□ 1.1
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