RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLIN1O60240 522 aa16.14■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDE3AQ14432 1141 aa16.14■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.14■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNAI2P04899 355 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPSM2P81274 684 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VPS33BQ9H267 617 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 XDHP47989 1333 aa16.13■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL4A5P29400 1685 aa16.12■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.12■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.12■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTX1Q13505 466 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.11■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSME4Q14997 1843 aa16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EYA3Q99504 573 aa16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POLLQ9UGP5 575 aa16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GGA1Q9UJY5 639 aa16.1■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C6orf229H3BNL8 230 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPIP5K2O43314 1243 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UFL1O94874 794 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHRNDQ07001 517 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA2012Q0VF49 1180 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 JDP2Q8WYK2 163 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COG6Q9Y2V7 657 aa16.09■□□□□ 0.17
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP2B4P23634 1241 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AOC3Q16853 763 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WASHC4Q2M389 1173 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.08■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SRGAP3O43295 1099 aa16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NIM1KQ8IY84 436 aa16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXO3Q9UK99 471 aa16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MED23Q9ULK4 1368 aa16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDR90Q96KV7 1748 aa16.07■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FZD9O00144 591 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COPRSQ9NQ92 184 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCN9AQ15858 1988 aa16.06■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCN4AP35499 1836 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EYA2O00167 538 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CIAO1O76071 339 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNJ4P48050 445 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRRC24Q50LG9 513 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.05■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLTPD2A6NH11 291 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF5LO75529 589 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.04■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMBP2O15034 1052 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP8B2P98198 1209 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POLA2Q14181 598 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 METTL24Q5JXM2 366 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP85Q6P2H3 762 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSH3Q8TE77 659 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.03■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE4AQ14139 1066 aa16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIL1Q9H173 461 aa16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ECE2O60344 883 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDE8BO95263 885 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPC2Q8N158 579 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YDJCA8MPS7 323 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259.4 ms