RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.81■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.8■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.78■■□□□ 1.08
PRRX1-208ENST00000553786 SULF1Q8IWU6 871 aa21.78■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.77■■□□□ 1.08
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PRRX1-208ENST00000553786 MYD88Q99836 296 aa21.73■■□□□ 1.07
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PRRX1-208ENST00000553786 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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PRRX1-208ENST00000553786 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.61■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 MOB2Q70IA6 237 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 OGFOD1Q8N543 542 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 FBXW7Q969H0 707 aa21.6■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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