RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.54■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.54■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 A0A1B0GUL6 1792 aa20.54■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 GNAI3P08754 354 aa20.53■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.53■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.53■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 XDHP47989 1333 aa20.53■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 PPIP5K2O43314 1243 aa20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 UFL1O94874 794 aa20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.52■□□□□ 0.88
GCN1-209ENST00000551920 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.52■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.51■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.51■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.51■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 C6orf229H3BNL8 230 aa20.5■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 CHRNDQ07001 517 aa20.5■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 GGA1Q9UJY5 639 aa20.5■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 FZD9O00144 591 aa20.49■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.49■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.49■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 SNAP23O00161 211 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 GNAI2P04899 355 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 KLRK1P26718 216 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 MTX1Q13505 466 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 LRRC24Q50LG9 513 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 VPS33BQ9H267 617 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 COG6Q9Y2V7 657 aa20.48■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 GLTPD2A6NH11 291 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 RIMBP2O15034 1052 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 TAF5LO75529 589 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 WASHC4Q2M389 1173 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 NIM1KQ8IY84 436 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 JDP2Q8WYK2 163 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.47■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 YDJCA8MPS7 323 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 MS4A1P11836 297 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 ATP2B4P23634 1241 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 MED23Q9ULK4 1368 aa20.46■□□□□ 0.87
GCN1-209ENST00000551920 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 PDE3AQ14432 1141 aa20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 EYA3Q99504 573 aa20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 SRGAP3O43295 1099 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 WDR90Q96KV7 1748 aa20.44■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 DOK7Q18PE1 504 aa20.43■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.43■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 SIL1Q9H173 461 aa20.43■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.43■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.43■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 EYA2O00167 538 aa20.42■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ECE2O60344 883 aa20.42■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 CXCL9Q07325 125 aa20.42■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.42■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 POTECB2RU33 542 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 COPRSQ9NQ92 184 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 SCN9AQ15858 1988 aa20.41■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 KIF3CO14782 793 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 RAD17O75943 681 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 KCNJ4P48050 445 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 POLA2Q14181 598 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 METTL24Q5JXM2 366 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GCN1-209ENST00000551920 CIAO1O76071 339 aa20.39■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 CEP85Q6P2H3 762 aa20.39■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 GPC2Q8N158 579 aa20.39■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 RRAGCQ9HB90 399 aa20.38■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.38■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GCN1-209ENST00000551920 PDE8BO95263 885 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms