RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.04■■□□□ 1.28
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COPS7A-216ENST00000543170 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.02■■□□□ 1.28
COPS7A-216ENST00000543170 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.02■■□□□ 1.28
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COPS7A-216ENST00000543170 MED23Q9ULK4 1368 aa23.01■■□□□ 1.27
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COPS7A-216ENST00000543170 PSME4Q14997 1843 aa22.97■■□□□ 1.27
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COPS7A-216ENST00000543170 PDE3AQ14432 1141 aa22.97■■□□□ 1.27
COPS7A-216ENST00000543170 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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COPS7A-216ENST00000543170 KCNJ4P48050 445 aa22.93■■□□□ 1.26
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COPS7A-216ENST00000543170 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.93■■□□□ 1.26
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COPS7A-216ENST00000543170 SRGAP3O43295 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC24Q50LG9 513 aa22.92■■□□□ 1.26
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COPS7A-216ENST00000543170 UBE4AQ14139 1066 aa22.91■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.91■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.91■■□□□ 1.26
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COPS7A-216ENST00000543170 ZNF609O15014 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
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COPS7A-216ENST00000543170 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 POTECB2RU33 542 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 TNIP1Q15025 636 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 METTL24Q5JXM2 366 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 PODNQ7Z5L7 613 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 COA1Q9GZY4 146 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 RRAGCQ9HB90 399 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 COG6Q9Y2V7 657 aa22.9■■□□□ 1.26
COPS7A-216ENST00000543170 G3V3G9 751 aa22.89■■□□□ 1.25
COPS7A-216ENST00000543170 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COPS7A-216ENST00000543170 DOK7Q18PE1 504 aa22.89■■□□□ 1.25
COPS7A-216ENST00000543170 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.89■■□□□ 1.25
COPS7A-216ENST00000543170 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.89■■□□□ 1.25
COPS7A-216ENST00000543170 PDE8BO95263 885 aa22.88■■□□□ 1.25
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