RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SHTN1A0MZ66 631 aa23.66■■□□□ 1.38
PUF60-218ENST00000531995 YDJCA8MPS7 323 aa23.66■■□□□ 1.38
PUF60-218ENST00000531995 F6X3S4 739 aa23.66■■□□□ 1.38
PUF60-218ENST00000531995 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.64■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.64■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 SCN9AQ15858 1988 aa23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 TMC4Q7Z404 712 aa23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 WBP1LQ9NX94 342 aa23.63■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 LBX1P52954 281 aa23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CST9Q5W186 159 aa23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CAPNS2Q96L46 248 aa23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 PTPRCP08575 1304 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 RIMBP2O15034 1052 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 GPSM2P81274 684 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 TNIP1Q15025 636 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 BEND3Q5T5X7 828 aa23.61■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 WASHC4Q2M389 1173 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 MICALL2Q8IY33 904 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 MYH3P11055 1940 aa23.6■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 C6orf229H3BNL8 230 aa23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 POLLQ9UGP5 575 aa23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.59■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 PSMD14O00487 310 aa23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 LINS1Q8NG48 757 aa23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 PSME4Q14997 1843 aa23.58■■□□□ 1.37
PUF60-218ENST00000531995 ECE2O60344 883 aa23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 DOK7Q18PE1 504 aa23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 TNNQ9UQP3 1299 aa23.57■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 RTL9Q8NET4 1388 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 ECE1P42892 770 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.56■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 H7C1W4 665 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 AOC2O75106 756 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 GCKRQ14397 625 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.55■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 H7C1D1 291 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 EGFRP00533 1210 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 CASP7P55210 303 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 DLK2Q6UY11 383 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 KIF16BQ96L93 1317 aa23.54■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 UFL1O94874 794 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 EYA3Q99504 573 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 TSKSQ9UJT2 592 aa23.53■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 TRIM27P14373 513 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.52■■□□□ 1.36
PUF60-218ENST00000531995 ALDH1L1O75891 902 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.51■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.5■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 USP48Q86UV5 1035 aa23.5■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.5■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 PDE8AO60658 829 aa23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 DPF2Q92785 391 aa23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 GGA1Q9UJY5 639 aa23.49■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ADM5C9JUS6 153 aa23.48■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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