RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 RAD17O75943 681 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRU-211ENST00000531385 CXCL9Q07325 125 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 DOK7Q18PE1 504 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 GGA1Q9UJY5 639 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-211ENST00000531385 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
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PTPRU-211ENST00000531385 EPHX2P34913 555 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRU-211ENST00000531385 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRU-211ENST00000531385 BCAR3O75815 825 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRU-211ENST00000531385 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 MXD3Q9BW11 206 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 EGFRP00533 1210 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-211ENST00000531385 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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