RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 A0A1B0GUL6 1792 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 C6orf229H3BNL8 230 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 TRAF5O00463 557 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 PSMD14O00487 310 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 CTSWP56202 376 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 FLIIQ13045 1269 aa24.19■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 RIMBP2O15034 1052 aa24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 ECE2O60344 883 aa24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 VAMP4O75379 141 aa24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 CST9Q5W186 159 aa24.17■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.17■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 ZNF609O15014 1411 aa24.17■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 H7C1W4 665 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 UFL1O94874 794 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 CASP7P55210 303 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 MICALL2Q8IY33 904 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 EYA3Q99504 573 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.15■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 DOK7Q18PE1 504 aa24.15■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 DPF2Q92785 391 aa24.15■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 GREM2Q9H772 168 aa24.15■■□□□ 1.46
CTTN-211ENST00000527622 EGFRP00533 1210 aa24.14■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 GCKRQ14397 625 aa24.14■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 GGA1Q9UJY5 639 aa24.14■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 XDHP47989 1333 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.13■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ZNF521Q96K83 1311 aa24.12■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.12■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 FOXN1O15353 648 aa24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 LINS1Q8NG48 757 aa24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 H7C1D1 291 aa24.09■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 WBP1LQ9NX94 342 aa24.09■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.09■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 MED23Q9ULK4 1368 aa24.08■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 FAM161AQ3B820 660 aa24.08■■□□□ 1.45
CTTN-211ENST00000527622 CSF1RP07333 972 aa24.07■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 ATP2B4P23634 1241 aa24.07■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 F6X3S4 739 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 DLK2Q6UY11 383 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 CAPNS2Q96L46 248 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 GMLQ99445 158 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.06■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 BEND3Q5T5X7 828 aa24.05■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.05■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.05■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 ITGA6P23229 1130 aa24.04■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 TNS4Q8IZW8 715 aa24.04■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.02■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 USP48Q86UV5 1035 aa24.02■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.02■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CTTN-211ENST00000527622 KLRK1P26718 216 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 FOXO4P98177 505 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 PODNQ7Z5L7 613 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.01■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 ECE1P42892 770 aa24■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 ADM5C9JUS6 153 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 AIDAQ96BJ3 306 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 GGA3Q9NZ52 723 aa23.99■■□□□ 1.43
CTTN-211ENST00000527622 USP17L3A6NCW0 530 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms