RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBASH3B-202ENST00000525711 GPSM2P81274 684 aa18.52■□□□□ 0.56
UBASH3B-202ENST00000525711 DOK7Q18PE1 504 aa18.52■□□□□ 0.56
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UBASH3B-202ENST00000525711 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.42■□□□□ 0.54
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
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UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
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UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.4■□□□□ 0.54
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UBASH3B-202ENST00000525711 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.39■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 PODNQ7Z5L7 613 aa18.39■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.38■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 PDE8AO60658 829 aa18.38■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.37■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP2B4P23634 1241 aa18.37■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 SREBF2Q12772 1141 aa18.37■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.37■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 OGFOD1Q8N543 542 aa18.37■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 LAMB1P07942 1786 aa18.37■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 ANP32CO43423 234 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 TM4SF4P48230 202 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 MOB2Q70IA6 237 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 RUNDC1Q96C34 613 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 GCC1Q96CN9 775 aa18.36■□□□□ 0.53
UBASH3B-202ENST00000525711 MYD88Q99836 296 aa18.36■□□□□ 0.53
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UBASH3B-202ENST00000525711 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
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