RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525524.1

EDRF1-211, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-211ENST00000525524 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.87□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.87□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 NAGPAQ9UK23 515 aa6.87□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.86□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.86□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.86□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 GHRHP01286 108 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 PERM1Q5SV97 790 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 GSC2O15499 205 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 FOXO3O43524 673 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 DKK1O94907 266 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 PSAPP07602 524 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 NOS3P29474 1203 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 INPP5BP32019 993 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 NRLP54845 237 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 DGKZQ13574 1117 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
EDRF1-211ENST00000525524 TOP2BQ02880 1626 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 SASH3O75995 380 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MICAL2O94851 1124 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PLAURQ03405 335 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 DPYDQ12882 1025 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 GLMNQ92990 594 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 KLK14Q9P0G3 267 aa6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 ILDR2Q71H61 639 aa6.82□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.82□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 IFT43Q96FT9 208 aa6.82□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MUC3BQ9H195 1237 aa6.82□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 CUL7Q14999 1698 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FAM196BA6NMK8 535 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L15C9J2P7 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L10C9JJH3 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L12C9JPN9 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L11C9JVI0 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L21D6R901 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L18D6R9N7 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L22D6RA61 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L19D6RCP7 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L20D6RJB6 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 USP17L24Q0WX57 530 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 GRIK5Q16478 980 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 ZFATQ9P243 1243 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 BCS1LQ9Y276 419 aa6.81□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 DLL1O00548 723 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FSTP19883 344 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PTK7Q13308 1070 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PLD4Q96BZ4 506 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.8□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 ASXL2Q76L83 1435 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FAM177BA6PVY3 158 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 XYLBO75191 536 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 SIK1P57059 783 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FBXO41Q8TF61 875 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 MYO19Q96H55 970 aa6.79□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 EGFRP00533 1210 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 GLB1P16278 677 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 GLI2P10070 1586 aa6.78□□□□□ -1.32
EDRF1-211ENST00000525524 PTPRGP23470 1445 aa6.77□□□□□ -1.33
EDRF1-211ENST00000525524 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.77□□□□□ -1.33
EDRF1-211ENST00000525524 F8W735 103 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
EDRF1-211ENST00000525524 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
EDRF1-211ENST00000525524 SSTR4P31391 388 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms