RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRK-218ENST00000525459 CIAO1O76071 339 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRK-218ENST00000525459 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTPRK-218ENST00000525459 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRK-218ENST00000525459 NEFLP07196 543 aa23.25■■□□□ 1.31
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PTPRK-218ENST00000525459 PSMD1Q99460 953 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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PTPRK-218ENST00000525459 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRK-218ENST00000525459 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRK-218ENST00000525459 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRK-218ENST00000525459 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 GPSM2P81274 684 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRK-218ENST00000525459 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 METTL24Q5JXM2 366 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRK-218ENST00000525459 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRK-218ENST00000525459 EYA3Q99504 573 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 MED23Q9ULK4 1368 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.14■■□□□ 1.3
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PTPRK-218ENST00000525459 RAB11FIP3O75154 756 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-218ENST00000525459 RASSF7Q02833 373 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SLC51AQ86UW1 340 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 POLLQ9UGP5 575 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRK-218ENST00000525459 TAF5LO75529 589 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-218ENST00000525459 GPR108Q9NPR9 543 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRK-218ENST00000525459 DCTPP1Q9H773 170 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SLC5A1P13866 664 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 GCC1Q96CN9 775 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 SASH1O94885 1247 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 FGFR2P21802 821 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-218ENST00000525459 TFCP2Q12800 502 aa23.08■■□□□ 1.29
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