RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522574.5

TNIP1-215, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, human

TSL 2

Gene TNIP1, Length 1,394 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNIP1-215	ENST00000522574	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	SASH1	O94885	1247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	LAMB2	P55268	1798 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	PDE8B	O95263	885 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	CHRND	Q07001	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	NUCB1	Q02818	461 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	TFCP2	Q12800	502 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	MYH3	P11055	1940 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	MPND	Q8N594	471 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNIP1-215	ENST00000522574	APBB1	O00213	710 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	C21orf2	O43822	256 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TAF5L	O75529	589 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	GPSM2	P81274	684 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	XDH	P47989	1333 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	FGFR2	P21802	821 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TIMM10	P62072	90 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	LPIN2	Q92539	896 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574		A0A1B0GUL7	405 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	SLC5A1	P13866	664 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	HSPA6	P17066	643 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	KCNJ4	P48050	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	PSMD1	Q99460	953 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	COL4A1	P02462	1669 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	SNAP23	O00161	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	GPR162	Q16538	588 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	AACS	Q86V21	672 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	EYA3	Q99504	573 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	TAF1	P21675	1872 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	ZBTB22	O15209	634 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNIP1-215	ENST00000522574	UFL1	O94874	794 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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