RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 PTPRCP08575 1304 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 PSME4Q14997 1843 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 GRM8O00222 908 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 ITGA6P23229 1130 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 FAM161AQ3B820 660 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 LDHDQ86WU2 507 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 A0A1B0GUL6 1792 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 RAD17O75943 681 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 UFL1O94874 794 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 EPS15P42566 896 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 GGA1Q9UJY5 639 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 XDHP47989 1333 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 HTRA3P83110 453 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 TNIP1Q15025 636 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 ECE2O60344 883 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 ATP2B4P23634 1241 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 DOK7Q18PE1 504 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-207ENST00000521825 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 UTYO14607 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 PSMD14O00487 310 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 KAZALD1Q96I82 304 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 PASKQ96RG2 1323 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 SUCLG2Q96I99 432 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 MED23Q9ULK4 1368 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 SHTN1A0MZ66 631 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 CHRNDQ07001 517 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-207ENST00000521825 G3V3G9 751 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 CNTROBQ8N137 903 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 DPF2Q92785 391 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 USP44Q9H0E7 712 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 PODNQ7Z5L7 613 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 MICALL2Q8IY33 904 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 KLRG1Q96E93 195 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 CREBZFQ9NS37 354 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF609O15014 1411 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 H7C1D1 291 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 KLRK1P26718 216 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 TAF5LO75529 589 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 SNAP23O00161 211 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 COA1Q9GZY4 146 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-207ENST00000521825 USP17L3A6NCW0 530 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-207ENST00000521825 USP17L4A6NCW7 530 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms