RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 CXCL9Q07325 125 aa32.39■■■□□ 2.78
TCEA1-202ENST00000517351 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
TCEA1-202ENST00000517351 XDHP47989 1333 aa32.38■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.38■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 MINPP1Q9UNW1 487 aa32.37■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 EPHX2P34913 555 aa32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 RARSP54136 660 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 EPHA10Q5JZY3 1008 aa32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 CIAPIN1Q6FI81 312 aa32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 DBNDD1Q9H9R9 158 aa32.36■■■□□ 2.77
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TCEA1-202ENST00000517351 POTEJP0CG39 1038 aa32.35■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
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TCEA1-202ENST00000517351 MPHOSPH8Q99549 860 aa32.35■■■□□ 2.77
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TCEA1-202ENST00000517351 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 ATP2B4P23634 1241 aa32.34■■■□□ 2.77
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TCEA1-202ENST00000517351 SCNN1DP51172 638 aa32.33■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 TNIP1Q15025 636 aa32.33■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 DOK7Q18PE1 504 aa32.33■■■□□ 2.77
TCEA1-202ENST00000517351 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
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TCEA1-202ENST00000517351 ECE2O60344 883 aa32.32■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 CHADLQ6NUI6 762 aa32.31■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 LDHDQ86WU2 507 aa32.31■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 G3V3G9 751 aa32.3■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 APLP1P51693 650 aa32.3■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC57Q2TAC2 916 aa32.3■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 DCAF8Q5TAQ9 597 aa32.3■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 EPS15P42566 896 aa32.29■■■□□ 2.76
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TCEA1-202ENST00000517351 KAZALD1Q96I82 304 aa32.29■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 ZBED9Q6R2W3 1325 aa32.28■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 KIF16BQ96L93 1317 aa32.28■■■□□ 2.76
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TCEA1-202ENST00000517351 USP44Q9H0E7 712 aa32.27■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 GPRC5DQ9NZD1 345 aa32.27■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 CLEC11AQ9Y240 323 aa32.27■■■□□ 2.76
TCEA1-202ENST00000517351 LEMD3Q9Y2U8 911 aa32.26■■■□□ 2.75
TCEA1-202ENST00000517351 PSMD14O00487 310 aa32.25■■■□□ 2.75
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TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa32.23■■■□□ 2.75
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TCEA1-202ENST00000517351 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
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TCEA1-202ENST00000517351 KCNJ4P48050 445 aa32.2■■■□□ 2.75
TCEA1-202ENST00000517351 CNNM1Q9NRU3 951 aa32.2■■■□□ 2.75
TCEA1-202ENST00000517351 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 TAF5LO75529 589 aa32.18■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 HTRA3P83110 453 aa32.18■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 PODNQ7Z5L7 613 aa32.18■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 DPF2Q92785 391 aa32.18■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 VIL1P09327 827 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 TXNRD3Q86VQ6 643 aa32.17■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 H7C1D1 291 aa32.16■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 RPS12P25398 132 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 MICALL2Q8IY33 904 aa32.16■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 A0A1B0GUL6 1792 aa32.16■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 SHTN1A0MZ66 631 aa32.15■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 KLRK1P26718 216 aa32.15■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 CNTROBQ8N137 903 aa32.15■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 COA1Q9GZY4 146 aa32.15■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 SNAP23O00161 211 aa32.14■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 PLIN1O60240 522 aa32.14■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa32.14■■■□□ 2.74
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM27P14373 513 aa32.13■■■□□ 2.73
TCEA1-202ENST00000517351 PSME4Q14997 1843 aa32.13■■■□□ 2.73
TCEA1-202ENST00000517351 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
TCEA1-202ENST00000517351 PASKQ96RG2 1323 aa32.13■■■□□ 2.73
TCEA1-202ENST00000517351 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
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